在污水運行和調試過程中，污泥膨脹是.棘手的問題之一。發生率高，發生后調整時間長。.可怕的是，調整方法有時候管用，有時候沒效果。基本上，污泥膨脹目前發生在各種類型的活性污泥工藝中。有人說SBR工藝或者有預生物選擇的工藝可以避免污泥膨脹，這是癡心妄想。只能說這種方法降低了污泥膨脹的概率，但是沒有一種工藝可以完全避免污泥膨脹。

更好的處理方法叫做“非絲狀菌引起的污泥膨脹”。非絲狀菌污泥膨脹有點類似人吃脂肪的情況。人吃多運動少，.容易發胖，因為能量轉化為脂肪儲存起來，主要吸收有機物的細菌也是如此。由于某種原因(比如水溫下降，或者有機質過高，或者氮磷不足等。)，細菌膠束中的細菌吸附有機物后無法對其進行處理，于是以多糖的形式將有機物儲存在細胞周圍。這些物質是親水性的，吸附大量水分后，細菌膠團變成膠狀像果凍一樣。氮磷缺乏引起的污泥膨脹原理類似。細菌的合成本身既需要碳，也需要氮和磷。由于缺乏氮和磷，有機物不能轉化為細菌，多余的碳元素以多糖的形式儲存在細菌周圍。